Tを用いた遺伝子編集の制御

Feb 15, 2024

Nature Plants (2023)この記事を引用

メトリクスの詳細

Agrobacterium tumefaciens による形質転換は、外来 DNA を植物ゲノムに導入するために使用される主な方法です 1,2。 アグロバクテリウム由来の転移 DNA (T-DNA) は、単一コピーとして、または複雑な連結形態で組み込まれる可能性があります 3,4 が、最終的な T-DNA 構造に影響を与えるメカニズムは不明のままです。 今回我々は、T-DNAにレトロトランスポゾン（RT）由来の配列を含めると、シロイヌナズナにおいてT-DNAのコピー数が50倍以上増加する可能性があることを実証する。 これらの追加の T-DNA コピーは大きなコンカテマーに組織化されます。これは主に、非 LTR DNA リピートを使用して複製できる RT の長末端リピート (LTR) によって引き起こされる効果です。 私たちは、T-DNA 連結が DNA 修復タンパク質 MRE11、RAD17、および ATR の活性に依存していることを発見しました。 最後に、T-DNA 連結を使用して、標的突然変異誘発と遺伝子ターゲティングの頻度を高めることができることを示します。 全体として、この研究はシロイヌナズナの T-DNA コピー数を調節する分子決定基を明らかにし、植物遺伝子編集における T-DNA 連結誘導の有用性を実証します。

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この研究から生成されたデータは、主要な図、拡張データ、および補足情報に含まれています。 生の配列データは NCBI SRA (BioProject PRJNA892619) に寄託されています。 データの分析には、TAIR10 シロイヌナズナ ゲノム (https://www.arabidopsis.org/download/index-auto.jsp%3Fdir%3D%252Fdownload _files%252FGenes%252FTAIR10_genome_release) およびソースされた「オルソロガス遺伝子ファミリー」リストが利用されました。 Dicots PLAZA 5.0 データベース (https://ftp.psb.ugent.be/pub/plaza/plaza_public_dicots_05/GeneFamilies/genefamily_data.ORTHOFAM.csv.gz) より。 データの利用可能性に制限はありません。 ソースデータはこのペーパーに付属しています。

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